Süngerler öncelikle kendilerini korumak için kimyasal maddeler kullanırlar ve kimyasallar ya zehirlidir ya da sadece tadı kötüdür. Bu, salıverilen kimyasalların diğer organizmaların yanlarında büyümesini engellediğinden, sadece yırtıcıyı değil aynı zamanda rekabeti de önler. . Bireysel türlerin, koruma kazanmak için mercanlara, kayalara veya yumuşakçalara yuvalanma gibi başka stratejileri vardır.
Bir çok mercanın deniz yıldızı gibi avcıları uzak tutmak için kullandığı bir başka strateji ise spikül adı verilen iskelet elemanlarının küçük parçalarını deniz tabanına dökmektir. Bunlar kalın bir tabaka halinde birikebilir ve onlara ulaşmak için sürünmeleri gereken avcıları caydırabilir. Tüm süngerlerin doğrudan bir savunma mekanizması yoktur. Cam süngerler toksin üretmez, ancak avcıların nadir olduğu çok derin okyanusta yaşarlar.
Savunmalarına rağmen, süngerler hareket edebildiklerinde sadece hafif hareketler yapabilirler. Savunmalarını yenebilecek tüm organizmalara karşı savunmasızdırlar ve birçok kaplumbağa, balık ve omurgasız türüne avlanırlar. Süngerler, yırtıcılardan kısmen yararlanabilir, ancak, yırtıcı hayvanların geride bıraktığı sünger parçaları sıklıkla hayatta kalabilir ve kendilerini bağımsız organizmalar olarak yeniden kurabilirler. Son derece basit hücre seviyesindeki organizasyonu, avcıların veya çevresel etkilerin neden olduğu ciddi hasarlarda bile hayatta kalabilecekleri anlamına geliyor.