Sudaki bütün kaplumbağalar su altında nefes alamaz, ancak bazıları su altındayken oksijen alma yöntemleri geliştirdiler. Okyanus Kaynak Vakfı'na göre, onların anal açıklıkları ile su.
Oksijen, boğazdaki cilt yoluyla veya anal alandaki özel torbalar yoluyla absorbe edilebilir. Ayrıca anal bölgede su altı solunumuna yardımcı olan solungaç yapılı en az bir tür vardır. Kaplumbağalar nefeslerini uzun süre boyunca tutabilirler, bazı türlerde üç saate kadar sürebilir ve karbondioksiti daha iyi tutabilirler, bu da ne sıklıkla nefes almaları gerektiğini azaltır.