PS2 oyunları PS3 40 GB oyun sisteminde oynatılamaz. Bazı PS3 modelleri PS2 yazılımıyla uyumlu olsa da, 40 GB oyun sistemi bunlardan biri değildir.
20GB, 60GB ve 80GB PS3 oyun sistemi modelleri, PS2 oyunlarıyla yazılım uyumludur. Diğer tüm PS3 modelleri, gerekli Emotion Engine ve gerekli PS2 devresinin dahil edilmemesi nedeniyle PS2 oyunlarının sistemlerinde oynanmasına izin vermez. İlk üç PS modeli PS2 oyunlarının oynanmasına izin vermesine rağmen, Sony, artan maliyet etkileri nedeniyle gelecekteki modellerde PS2 uyumluluğu dahil etmeyi bıraktı.