ROM1.bin ve SCPH1000.bin gibi BIOS dosyalarının, PS2emu'nun çalışması için ROM'ların depolandığı aynı klasöre yerleştirilmesi gerekir. Herhangi bir PS2 emülatörünün çalışması için BIOS'lar gerekir. BIOS, “temel giriş /çıkış sistemi” anlamına gelir ve bunlar yalnızca PS2 emülatörlerinden daha fazla kullanılır.
PS2 emülatörleri için birden fazla BIOS dosyası var. Bu, SCPH1000.bin, SCPH100.bin ve SCPH7003.bin'yi içerir. Bir PS2 öykünücüsünün çalışması için oyuncular bu dosyalardan yalnızca birine ihtiyaç duyarlar. Her BIOS dosyası, PS2'nin piyasaya sürüldüğü farklı bir bölgeyle ilgilidir. Örneğin, SCPH1001.bin Amerika'da piyasaya sürülen PS2'nin BIOS dosyası, SCPH1000.bin ve SCPH7003.bin sırasıyla Japonca ve Avrupa sürümleri içindir.