Merle Chihuahua, benekli paltolu bir Chihuahua'dır. Merle, pek çok yerli köpek ırkında bulunan bir palto modelidir; aynı renk tonunda daha açık bir arka plan üzerinde daha koyu renk lekelerinden oluşur.
Chihuahua'da merle, bir çok sağlık problemi ile güçlü bir şekilde ilişkilidir. Göz, kafatası ve üreme sisteminin sağırlığı ve anormallikleri ile bağlantılıdır. FCI Avrupa standartlarını kullanan 83 ülkenin tamamı dahil olmak üzere birçok ülke, daha fazla üremeyi engellemek amacıyla merle Chihuahua'ların kayıt altına alınmasını yasakladı. Amerikan Kennel Kulübü, 2014 yılı itibariyle, Merle dahil, gösteri kalitesindeki Chihuahua'larda herhangi bir ceket veya desen kabul ediyor.
