İki günlük bir sıvı diyeti, genellikle bir kolonoskopi için yeterli hazırlık değildir. Hazırlık, genellikle işlemden bir gün önce başlayıp berrak bir sıvı hazırlama hazırlığı yapılmasını gerektirir, Harvard Health Yayınlar. Kolonoskopi hazırlığıyla ilgili özel soruları işlemi yapan doktora yönlendirmek en iyisidir.
Bağırsak temizleme hazırlığının alınması, bağırsak içeriğinin tamamen boşaltılması önemlidir. Yetersiz bir bağırsak hazırlığı, Harvard Sağlık Yayınlarına göre poliplerin ve lezyonların kaçırılmasına, daha uzun bir prosedüre veya prosedürün iptal edilmesine ve yeniden planlanmasına neden olabilir. Kolonoskopiden birkaç gün önce tam tahıl, fındık, tohum ve çiğ meyve ve sebze içermeyen düşük lifli bir diyet başlatmak da tavsiye edilir.