Tohum Kılavuzları, kenevir yağının, karın krampları ve diyare gibi küçük sindirim sistemi yan etkilerine neden olabileceğini iddia eder. Kenevir yağı dışkıları yumuşatma özelliğine sahiptir.
Eğer kenevir yağı tüketiminden dolayı ishal aşırı ise, Tohum Kılavuzlarına göre bu durumun emilim bozukluğuna neden olabilir. Bağırsak hareket bozuklukları veya sindirim problemleri öyküsü olan insanlar kenevir yağı tüketmemelidir.
Kenevir yağı, tetrahidrokannabinol veya nörolojik bir kimyasal olan THC içeren bir bitkiden elde edilir. THC düzenli olarak kullanıldığında endişe ve halüsinasyonlara neden olabilir. Tohum Kılavuzları, bazı bireylerin THC'ye özellikle duyarlı olduğunu ve bunu doğrulamak için doktorları tarafından incelenmesi gerektiğini belirtir.