ArsPechnica.com web sitesi ve GamePedia.com'daki Minecraft wiki, bir Minecraft sunucusunun nasıl başlatılacağına ilişkin ayrıntılı talimatlar sunar. Kullanıcılar sunucuyu manuel olarak ayarlayabilir veya önceden yapılandırılmış bir sunucu için ödeme yapabilir. ServerCraft ve BeastNode gibi sunucu sağlayıcılar, aylık ücret karşılığında tamamen yapılandırılmış Minecraft sunucuları sunar. Bir Minecraft sunucusunu manuel olarak yapılandırma adımları, Java Runtime Environment ürününü kurmak, Minecraft web sitesinden "Minecraft Multiplayer Server" uygulamasını kurmak ve sunucuyu ayarlamaktır.
Minecraft sunucusu, Java web sitesinde mevcut olan Java Runtime Environment uygulamasını çalıştırır. Güvenlik nedeniyle, Java'yı en son sürüme güncellemek önemlidir. İlk önce Java'yı yüklemeden "Minecraft Multiplayer Server" programını kurmaya çalışırsanız, program Java web sitesine yönlendiren bir tarayıcı penceresi açar.
Java yüklendikten sonra, Minecraft.com adresinden "Minecraft Multiplayer Server" dosyasını indirin. Windows kullanıcıları bu programı EXE veya JAR formatında indirebilirler. Mac ve Linux kullanıcıları JAR dosyasını indirmelidir. Minecraft için bir dizin oluşturun ve bu dizindeki EXE veya JAR dosyasını indirin. Ardından Minecraft sunucusunu başlatmak için indirilen dosyayı çalıştırın. Minecraft wiki ve ArsTechnica.com, JAR dosyasını çalıştırma komutları hakkında ayrıntılı talimatlar sağlar.
Minecraft sunucusunu kurduktan sonra, kullanıcılar manuel olarak yapılandırabilir. Minecraft Wiki, oyuncu sayısı, zorluk ve oyun modu gibi sunucunun özelliklerinin ayrıntılı bir listesine sahiptir.