Islak montajlarda ideal olarak hava kabarcığı bulunmamalıdır, çünkü yeni başlayanlar mikroskobun altına bakarken kabarcıkları numuneden ayırmakta zorlanabilirler. Kabarcıkların varlığı ayrıca canlı organizmaların serbestçe hareket etmesini önleyebilir. Diğer bir problem de büyük baloncukların görüntüleme çözünürlüğünü azaltabileceğidir.
Islak montajları görüntülemek için kullanılan mikroskoplar, numune suya batırıldığında en yüksek kalitede çözünürlük sağlamak için tasarlanmıştır. Örneği su yerine büyük bir hava kabarcığı çevrelerse, görüntünün kalitesi düşer. Islak montajlardaki hava kabarcıkları ile ilgili bir diğer sorun, mikroskop altında kenarlarını çevreleyen koyu renkli bir halka oldukları görünmektedir. Bu koyu renkli halka numunenin bir kısmını kaplayabilir, bu da görüntülemesini zorlaştırır.
Bazı örnek türleri hava kabarcıklarına diğerlerinden daha yatkındır. Kabarcıklar, soğan derisi dilimleri gibi büyük tabakalar şeklinde olan numunelerin altında kolayca sıkışabilir. Gözenekli örnekler de hava kabarcıklarına eğilimlidir çünkü gözenekleri ıslak montaj oluşturmadan önce hava ile doldurulabilir. Bir vakum, gözeneklerden havanın emilmesi için faydalıdır. Yağ yüzeyli numuneler de kolayca hava kabarcıkları oluşturur, çünkü su itmezler. Yağ tabakasını çıkarmak için numuneye alkol uygulanması, hava kabarcıklarını önlemeye yardımcı olabilir.
