Iroquois'in dini inançları, farklı kabilelerin birbirinden uzak yaşadığı ve uygulamalarının yazılı kayıtlarının az olduğu için değişmiştir. Ancak, bazı yaygın inanışlar arasında Sky Woman, Thunders, İkiz Tanrılar ve Onatah da dahil olmak üzere belirli tanrı ve tanrıça benzeri putlara tapma yer almaktadır.
Iroquois'in kutladığı putlardan bazıları şunlardır:
- Gökyüzü Kadını - Iroquois kabilelerinin anası sayılır, efsaneler gökten düştüğünü belirtir.
- İkiz Tanrılar - İnsanları yaratan varlıklar olduğu söylenirken, İkiz Tanrılar Gökyüzü Kadını'nın torunlarıydı. Bir ikiz, insanlığa yardım eden iyi bir ruh iken, diğeri onlar için engeller yaratan şeytani mevkidaşıydı.
- Şimşekler - Bu canlılar gökyüzünde yaşadı ve gökgürültüsüne neden oldu. Liderleri Hino adında bir tanrıydı.
- Büyük Ruh - Tarihçiler kimliğinden emin değillerdir, çünkü Hıristiyan misyonerler bu anlatıyı etkilemiştir. Bazıları onun İkiz Tanrıların iyi bir ilahı olduğuna inanırken, bazıları onun Hino olduğunu söylüyor.
- Onatah - Onatah, bereket tanrıçası olduğu kadar mısırın da ruhuydu.
- Mitolojik yaratıklar - Bu yaratıklar, Büyük Göller'de yaşayan Oniare adında ejderhaya benzer bir yılan olan ve Jogahs adlı cüce benzeri doğa ruhları olan Çıplak Ayı'yı içeriyordu.
