Bağırsak metaplazisinin ilk aşamasında, hastanın hasarlı özofagus astarı, özofagusun normal skuamöz hücrelerinin yerine, bağırsak duvarını kaplayan hücrelerin tipini büyütmeye başlar, Johns Hopkins Patolojisi'ni açıklar. Zamanla, bu hücreler normal hücrelerin yerini alır ve bu durum Barrett's özofagusu olarak adlandırılır. Doktorlar sonraki iki aşamayı düşük dereceli displazi ve yüksek dereceli displazi olarak nitelendiriyor ve bu aşamaları öncül olarak görüyorlar. Bu hücrelerin invaziv karsinoma olma riski çok yüksektir.
Doktorlar, bağırsak metaplazisi sürecinin gastroözofageal reflü cevabına başladığına inanıyor, Johns Hopkins Patolojisini söylüyor. Mide asidinin özofagus içine yeniden toplanması, zedelenmesine zarar verir ve vücut hasarı onarmaya çalışırken yanlış türde hücrelerin büyümesine yol açabilir. Bu hücreler normal özofagus hücrelerine göre daha az hassastır, bu nedenle hastalar bu aşamaya ulaştığında, genellikle semptomlarından rahatlama hissederler. Bununla birlikte, bu aşamada hastanın özofagus kanseri riski, genel popülasyona göre 30 ila 125 kat artar.
Johns Hopkins Patolojisi,Barrett's özofaguslu hastaları yakın tıbbi gözetim altında tutarak, doktorların yayılma şansı olmadan kanserli hücrelerin görünümünü tespit edebildiklerini söylüyor. Yemekhane öncesi yemek borusu biyopsileri, doktorların tanıdığı ve izleyebileceği genetik anormallikleri ortaya koyuyor.