Granülomlar en çok enfeksiyonlarla, özellikle de mantar enfeksiyonu histoplazmozları ile ilişkilidir, Mayo Clinic. Amerikan Alerji, Astım ve İmmünoloji Akademisi, kronik granülomatöz hastalık olarak bilinen primer bir immün yetmezlik hastalığı ile de ilişkilidir.Mayo Clinic'e göre, öncelikle akciğerleri etkileyen ve üst Orta Batı ve Ohio Vadisi ile ilişkili olan histoplazma, ABD'de en sık görülen granülom nedenidir. Hastalığın semptomları nadirdir ve doktorlar en sık başka nedenlerden dolayı göğüs röntgeni çekerken teşhis eder. Röntgende kansere benzemesine rağmen, histoplazmoz ile ilişkili granülomlar iyi huyludur. Histoplazmoz normalde izleme veya tedavi gerektirmez.
CGD vakalarında, vücudun yaralarının gerektiği gibi iyileşememesi nedeniyle granülomlar gelişebilir, Amerikan Alerji, Astım ve İmmünoloji Akademisi'ne dikkat çeker. Bu hastalık ile vücut, doğal hidrojen peroksit üretimini gerektiren enfeksiyonlarla savaşamaz. Enfeksiyonlar akciğerleri, cildi, lenf bezlerini, kemikleri ve karaciğeri etkileyebilir. Doktorlar, hastalığı, vücudun hidrojen peroksit seviyelerini ölçerek teşhis eder ve tedavi, önleyici antibiyotiklerin kullanımını içerir. Ciddi durumlarda, kemik iliği nakli gerekli olabilir. CGD'li hastalar klorlanmamış suda yüzmekten, mahzenleri temizlemekten, bitkileri silmekten ve bahçeyi mahvetmekten kaçınmalıdır.