Federalistler, 1812 Savaşına karşı çıktılar çünkü Thomas Jefferson ve daha sonra James Madison başkanlığında savaş ilan eden muhalif partinin politikaları, Federalist'in New England kalesini yoksulluğun sınırına getirdi. Thomas Jefferson’un Amerikan gemi ambargosu, ABD’deki gemileri ve denizcileri korumak yerine, büyük bir işsizlik, bankaların kapanmasına neden oldu ve ticarette sanal bir durgunluk yarattı.
James Madison'ın Demokrat-Cumhuriyetçileri İngiltere ile savaşı yalnızca nakliye sorununu hafifletmek için değil, batı eyaletlerine ve bölgelerine Kanada'dan toprak ele geçirme fırsatı vermek için de ilan ettiler. Savaş ilanından sonra Kongre’yi dar bir aralıkta geçtikten sonra bile, Federal devletler devlet milislerinin savaş çabalarına katılmalarına izin vermeyi reddettiler. Madison'ı yolsuzluk ve Napolyon Bonapart ile bir ittifak kurmak istemekle suçladılar. Öte yandan Demokrat-Cumhuriyetçiler, Federalleri milleti bölmek ve İngiltere ile yeniden uyum kurmak istemekle suçladılar. Bazı New England valileri savaş çabalarını açıkça kınadılar.
1814 Aralık'ında, bölücü ikilemin çözümlerini tartışmak için Hartford Sözleşmesinde toplanan bir dizi New England eyaletinden delegeler. Bununla birlikte, kongre temsilcileri Washington’da önerilen Anayasa değişikliklerinin bir listesi ile geldiklerinde İngiltere ile barış antlaşması imzalandı ve savaş sona erdi. Bundan sonra, Federalist Parti reddetti ve nihayetinde ortadan kayboldu.
