Köpekbalıkları apeks avcılarıdır, yani besin zincirinin en üstündedirler. İştahları ve varlıkları, avlarının popülasyon kontrolünü sağlamanın bir parçasıdır; bu da habitatların aşırı otlatılmasını ve hastalığın veya hastalığın yayılmasını önler.
Birçok köpek balığı balığa avlanır, yaşlı, hasta ya da zayıf beslenir ve balıkların habitatlarını yıkmalarını engellerken gen havuzunu güçlendirir. Bazı türler foklarla veya diğer deniz memelileriyle beslenir. Köpekbalıkları türlere göre farklı açlıklara sahip olsalar bile, varlıkları bile popülasyonu dağıtmak için yeterli av hayvanlarını korkutup habitatın aşırı otlatılmasını önleyebilir. Bu nedenle, bilim adamları, onları okyanusta yaşayan canlıları değil aynı zamanda insanları da etkileyen, ekosistemin tamamını yok edebilecekleri anlamına gelen, onları temel taş türü olarak sınıflandırdılar. Ton balığı da dahil olmak üzere ticari açıdan önemli balık ve kabuklu deniz hayvanlarının kaybının, köpekbalıklarının ortadan kaldırılmasından sonra balıkçılığı olumsuz yönde etkilediği görülmüştür.
Köpekbalıkları tehlikeye atılma riski altındadır. Mangrovların ve resiflerin üreme ve habitatlarını kirletme durumlarının tahrip olmasıyla kötüleşen üreme hızları düşüktür. Yüzgeçleri için insanlar tarafından avlanırlar. Popülasyonları, balıkçılıkta yanlışlıkla avlanma nedeniyle de ciddi şekilde zarar görmektedir.
