Armut başlı bir Chihuahua ve elma başlı bir Chihuahua arasındaki fark kafatasının şeklidir. Elma başlı bir Chihuahua, elmaya benzeyen yuvarlak, kubbeli bir kafatasına sahiptir. Armut başlı veya geyik şekli, bir elmadan daha fazla bir armuğa benzeyen, daha uzun namlu ile düzdür.
Amerikan Chihuahua Irk Kulübü'nün resmi standardına göre, bir Chihuahua'yı doğru görmek her zaman "elma başı" dır. Köpeğin başı kubbeli yuvarlak bir şekil olmalıdır. Genetikçiler, elma şeklinin brakisefali ve hidrosefali'ye neden olan mutasyonların bir kombinasyonunun bir sonucu olduğuna inanırlar. Brachycephaly, kafasının önünde "ezilmesine" neden olan ve kısaltılmış bir ağza yol açan bir malformasyondur. Hidrosefali, beyin çevresinde ciddi sağlık sorunlarına neden olabilen aşırı miktarda sıvıdır. Geyik şekli biraz brakisefali gibi görünmektedir, ancak hidrosefali ile ilgili kubbesi eksiktir. Armut kafalı köpekler daha az sağlık probleminden muzdariptir ve belki de hidrosefali olmadığı için itaat treni yapmak daha kolay olabilir.
Amerikan Chihuahua Irk Kulübü'ne göre, birçok Chihuahua hidrosefali ile ilgili sağlık sorunları yaşıyor. Obstrüktif hidrosefali belirtileri uykululuk, saldırganlık, kapma zorluğu, değiştirilmiş yürüyüş ve aşırı durumlarda nöbetleri içerir. Bununla birlikte, Chihuahua'nın engelleyici olmayan hidrosefali varsa, belirgin bir klinik bulgu olmayabilir.
