WebMD'ye göre, yoğurt güvenli kabul edilir ve sağlıklı bireylerde yan etki riski azdır. Bu nedenle yoğurt, diyetin bir parçası olarak çocuklar, yetişkinler ve hamile kadınlar tarafından düzenli olarak tüketilebilir. Bazı durumlarda, yoğurt bakterilere bulaşır ve hastalığa neden olur. Bu nedenle, kirlenmeyi önlemek için yoğurtun uygun şekilde hazırlanması ve saklanması önemlidir.
HIV'li veya organ nakli geçirmiş insanlar gibi bağışıklık sistemi zayıflamış kişiler için, yoğurt yemek küçük bir risk oluşturur. Bu gibi durumlarda, yoğurttaki canlı bakterilerden biri olan Lactobacillus'un vücutta hastalıklara neden olabilecek seviyelerde üremesine izin verilme riski vardır. Bu nadir olsa da, bağışıklık sistemi zayıflamış kişilerin ilk önce doktora gitmeden canlı kültür içeren fazla miktarda yoğurt yemekten kaçınmaları gerekir.
Sütün fermantasyonu yoluyla yapılan yoğurt, antibiyotik kullanımından sonra bağırsaklarda bulunan normal bakterileri restore etmek için çare olarak kullanılır. Düzenli yoğurt tüketiminin, vajinal bakteriyel ve maya enfeksiyonlarının tedavisinde ve idrar yolu enfeksiyonlarının önlenmesinde etkili olduğu bulunmuştur. Yoğurt tüketimi aynı zamanda yüksek kolesterolü yönetmek ve Helicobacter pylori enfeksiyonlarını tedavi etmek için de etkilidir.