Tıpta ultrason kullanmanın birkaç tanesi dezavantajı var; bunlardan biri operatör hatası potansiyeli. Bazı makineler de sınırlı çözünürlükte görüntüler üretiyor.
Ultrason, gaz içeren vücudun herhangi bir bölümünü incelemek için kullanılamaz, bu nedenle akciğer ve sindirim sistemi sorunlarının teşhisi için kullanışlı bir araç değildir. Bu tür bir çalışma, kemik kırığı ve diğer problemleri tanımlamak için kullanıldığında da çok sınırlıdır.
CancerQuest web sitesi, bazı ultrason taramalarının yanlış pozitifler üretebileceğini, hastaların biyopsilere ve gerekli olmayan diğer istilacı işlemlere neden olabileceğini söylüyor. Ultrason aynı zamanda meme dokusunun kireçlenmesini tespit edememektedir, bu da bazı meme kanseri türlerini tespit etmekte daha az faydalı olmaktadır.
