Timsahlar, ciğerlerine hava soluyarak nefes alırlar. Solungaçları yoktur ve su altında nefes alamazlar, ancak iki saate kadar aralıklarla su altında kalabilirler ve sularını tutabileceklerine inanılır. Gerekirse daha uzun nefes alın.
Timsah akciğerleri tek yönlü hava akışına sahiptir, bu da ciğerlerden geçen havanın büyük ölçüde temiz hava olduğu ve yüksek oksijen içeriğine sahip olduğu anlamına gelir. Kuş akciğerleri de tek yönlü hava akışına sahiptir. Memelilerin akciğerleri, çift yönlü hava akışına sahiptir, yani hava ciğerlerin içinde ve dışında hareket eder. Bu nedenle, bir memelinin ciğerlerine giren hava, bir süre ciğerlerinde bulunan havayla karışır. Bu karışık hava daha az oksijene sahiptir. Timsah akciğerlerinde kana karışmak için daha fazla oksijen bulunur.
Timsahlar öncelikle tatlı sularda yaşarlar. 10 ila 15 dakika arasında kendilerini su altında bırakma eğilimindedirler. Bir timsah su altına girdiğinde, burun delikleri, kulakları ve boğazı bir flep ile otomatik olarak kapanır. Bu kapaklar suyun ciğerlere veya mideye girmesini önler. Timsahlar kalp atışlarını yavaşlatır ve vücutlarındaki belirli kan hatlarını kapatarak hayati organlara daha fazla kan almalarını sağlar. Kan, bu organlara oksijen taşıyarak, timsahın nefes alma ihtiyacını geciktirir.
