Su kaplumbağaları, çeşitli bitki örtüsü, et ve ticari olarak hazırlanmış kaplumbağa veya balık yiyeceklerini besler. Genç kaplumbağalar, yapraklı yeşillikler, havuçlar ve kereviz gibi bitki örtüsünde daha yüksek bir diyete ihtiyaç duyarlar. Daha eski kaplumbağalar et, balık, karides ve solucanlar gibi et içeriklerinde daha yüksek bir diyet gerektirir.
Ticari olarak hazırlanmış kaplumbağa yiyecekleri kabul edilebilir ve esir kaplumbağaların sağlıklı bir kabuk tutması gereken mineraller ve vitaminlerle takviye edilir. Kaplumbağa sahipleri uygun beslenmeyi sağlamak için toz kalsiyum ve kemik unu ile takviye edebilir.
Genç kaplumbağalar günlük beslenmeyi gerektirir, ancak bu program daha büyük kaplumbağalar için haftada iki ya da üç kere azalır. Tüm su kaplumbağalarının yutulmasına yardımcı olmak için su ile beslenmesi gerekir.