Sahra Çölü'nün bitkileri, vahşi yaşamı ve genel ekosistemi, aşırı hayvancılık, yakacak odun talebi, sulama gelişimi ve yiyecek ve spor için avlanma gibi insan faaliyetleriyle tehdit altında. Sahara'nın en büyük çevresel tehditlerle ve bozulmalarla karşı karşıya kalan bölgeleri, kalıcı su kaynaklarına veya vahalara yakındır.
Yetersiz miktarda bitki örtüsünden otlayan yüksek evcil hayvan popülasyonundan dolayı bitki yaşamının vahalara yakın yaşayabilirliği tehdit altındadır. Ek olarak, yerel sakinler yakacak odun için bitkileri uzaklaştırır ve bu da üretilebileceğinden yüzde 30 daha hızlı kullanılmasıyla sonuçlanır. Kasabalarda ve şehirlerde yaşayan insanlar, evlerinden 300 kilometre uzakta bulunan odunları ararlar. Ayrıca, sulanan suyun gelişimi, drenaj sorunları nedeniyle toprakta yüksek seviyede tuz oluşmasına neden olmuştur.
Bitki ömrünün bozulması havadaki tozun artmasına ve yağışların azalmasına neden olur. Dahası, antilop gibi çöl yaşam alanlarına adapte olmuş hayvan popülasyonları, hem yemek hem de spor için avlanma yoluyla büyük ölçüde azaltılmıştır.
Aynı zamanda Büyük Çöl olarak da bilinen Sahra Çölü, büyük oranda el değmemiş ve sevilmemiştir. Dünyadaki en büyük sıcak çöl ve Afrika kıtasının kabaca yüzde 10'unu oluşturuyor. Sahara'da bulunan çok yıllık bitkiler, hem insanlar hem de hayvanlar için çevresel stabilite ve yiyecek yaratabilir. Bu bitkilerin meyve, tohum ve yaprakları beslenme, bitki örtüsü ve yakacak odun kaynağı sağlar. Çok yıllık bitkiler için tarım alanları ayrıca nesli tükenmekte olan türler için koruma sağlayabilir.