Pearl Harbor'a saldırı sırasında kullanılan silahlar arasında bombalar, torpidolar, makineli tüfekler ve uçaksavar silahları vardı. Japon bombaları ve torpidoları, B5N2 bombardıman uçakları ve Aichi D3A1 dalış bombardıman uçakları da dahil olmak üzere çok sayıda uçak tarafından düşürüldü. Japonlar ayrıca Pearl Limanı çevresindeki hava üslerini yapmak için A6M Model 21 Zeros'u kullandı.
Daha büyük B5N2 bombardıman uçaklarının her biri bir tek Tip 91 Model 2 torpido taşıdı. Bu torpidolar, pervanelerinin etrafına tahta kanatçıklarla donatıldı ve bu da limanların sığ sularında çalışmalarına yardımcı oldu. Her bir torpil yaklaşık 1.847 pound ağırlığında ve 452 pound bir savaş başlığına sahipti. B5N2 bombardıman uçağının ayrıca uçağın kuyruğunda bulunan 30 kalibrelik bir makineli tüfeği vardı;
İlk dalgadaki 89 bombardıman uçağının 40'ı, Tip 91 Model 2 torpidolarını taşıdı. Diğer 49 bombardıman uçağı, 1.763 pound ağırlığında birden fazla Tip 91 Model 5 bomba taşıdı. Model 5 bombası, yüksek bir rakımdan düştüğünde hedef geminin birden fazla güvertesini delme yeteneğine sahipti.
Küçük Aichi D3A1 dalış bombardıman uçaklarının her biri, 551 pound ağırlığında tek bir Tip 98 kara bombası taşıyordu. Bu bombalar, Pearl Harbor çevresindeki hava pistlerine ve hava tabanlarına saldırırken kullanılmak üzere özel olarak tasarlandı. Dalış bombardıman uçakları bombalarını düşürdükten sonra, makineli tüfekleri ve 20 milimetre toplarıyla yer hedeflerini vurmak için A6M Model 21 Zeros'a katıldılar.