Güney Carolina bayrağındaki hilal ay, Devrim Savaşı sırasında Güney Carolina askeri üniformalarında bulunan dekoratif hilaleye bir haraç olarak eklendi; Palmetto ağacı İç Savaş sırasında Güney Carolina eyalet ağacı olarak eklendi. Bayrak, mevcut bayrakta görülen tasarıma ulaşılmadan önce birkaç kez güncellendi ve revize edildi.
Albay William Moultrie, hilal bayrağını mavi olarak tasarladı, çünkü 1775'teki Devrim Savaşı’nda askerlerin üniformalarıyla aynı renkteydi. Yaklaşık 100 yıl sonra, Güney Carolina’nın birlikten ayrılmasıyla devlet halkı yeni bir bayrak istedi yeni statülerini anmak için. Eski bayrağa başlamayı seçtiler, ancak merkeze bir palmetto ağacı eklediler, çünkü burası Güney Carolina eyalet ağacı. Palmetto ağacının devlet ağacı olmasının nedeni kesin olarak bilinmemekle birlikte söylenti, Albay Moultrie'ye ve Sullivan'ın Adasını 1776'da İngilizlere karşı savunmasına geri döndüğü yönünde. İngilizler buradaki kaleye ateş etti. top mermileri, kaleyi tahrip edemedi, çünkü o palmetto ağaçlarından yapılmış. Top mermileri, kırmak yerine sadece yumuşak kütüklere batar. Güney Carolina, bayrağı İç Savaştan uzak tutmayı seçti ve bugün kullandıklarını seçti.