Örümcek Adam’ın genellikle belirli bir zayıflığı olmadığı veya en azından Süpermen’in Kryptonite’e karşı zayıflığı yolundaki komploya entegre olmayan hiç biri olmadığı söylenir. İnsanoğlunun bilinçli örümcek duygusu ve insanüstü fiziksel yetenekleri onu zarar vermekten neredeyse tamamen etkilemez kılıyor.
Ancak, Spider-Man'ın karakter profili aynı zamanda bu özerk refleksleri bilişsel olarak geçersiz kılarak kendisini sabote edebileceğini belirtir. Başka bir deyişle, kendi içgüdülerine inanç duymamak, ciddi bir zayıflığı temsil eder.
İçgüdülerine olan bağımlılığı da bir zayıflık olarak kabul edilebilir. Örneğin, bir soğuk algınlığı "The Amazing Spider-Man # 39" (1966) 'daki örümcek-duyusunu zayıflattığında, Yeşil Goblin kendine göre belirgin bir avantaj elde etti.
Pek çok süper kahraman gibi, Spider-Man de mayını teyzesinin sağlığı gibi aile veya kişisel bağların yanı sıra elektriğe karşı da hassastır.
