Noonan sendromunun belirtileri arasında kısa boy, perdeli veya geniş bir boyun, karakteristik yüz görünümü ve doğuştan kalp defekti sayılabilir, Ulusal İnsan Genomu Araştırma Enstitüsü. İnsanlar ayrıca sıradışı bir göğüs şekline, hafif gelişimsel gecikmelere ve kanama veya morarma problemlerine sahip olabilir. Noonan sendromundan muzdarip insanların yüzde 95'inde hafif göz problemleri varken, erkeklerde inmemiş testisler olabilir.
Noonan sendromunun en önemli belirtilerinden biri kişinin yüz görünümüdür, Mayo Clinic. Erken bebeklik döneminde çocuğun aşağı doğru eğimli gözleri, alçak kulakları ve kısa boynu olabilir. Noonan sendromlu çocuklar ifadesiz görünür ve ergenliğe yaklaştıkça yüzleri alnından genişler ve çene işaret eder. Boyunları cilt kıvrımlarını ortaya çıkarmak için uzar. Noonan sendromlu yetişkinlerde şeffaf görünen buruşuk bir cilde sahip olabilir.
Mayo Clinic'e göre, Noonan sendromu olan bireylerin yüzde sekseni, kapak hastalıkları, hipertrofik kardiyomiyopati ve kalp deliği gibi yapısal bozukluklar gibi doğuştan kalp kusurları ile doğmaktadır. Beslenme problemleri nedeniyle kişi çocukluk ve ergenlik yılları boyunca büyümeyi geciktirmiş olabilir. Noonan sendromlu kişilerde göz koşulları çok yaygındır. Göz kasları ile ilgili problemleri olabilir, çapraz gözler veya şaşılık gibi durumlar ile sonuçlanabilir. Ayrıca kırılma sorunları ve gözlerindeki sinirlerle ilgili sorunlar olabilir. Böbrek problemleri nadir ve hafiftir. Erkeklerde inmemiş testisler nedeniyle kısırlık olabilir. Noonan sendromlu bireyler genellikle soluk yeşil veya mavi gözlere ve kıvırcık, seyrek saçlara sahiptir.