ABD hükümeti tarafından yapılan bir 2012 tahminine göre, Mısır'daki ana din İslam'dır. Mısır halkının yaklaşık yüzde 90'ı Sünni Müslümanlardır.
Şii Müslümanları nüfusun yaklaşık yüzde 1'ini oluşturuyor. Mısır'daki insanların yüzde 9'unun çoğu Hristiyan olarak tanımlanıyor, ancak çeşitli mezheplerin mensupları. Mısır'daki Hristiyanların çoğunluğu Kıpti Ortodoks Kilisesi'ne, geri kalan kısmı ise Roma Katolik, Maronit, Ermeni Apostolik, Ortodoks ve Anglikan kiliselerine aittir. Küçük bir Protestan topluluğu da var. Mısır'da yalnızca 70 civarında Yahudi insan var ve bunların çoğu yaşlı. Merkezi Kamu Mobilizasyonu ve İstatistikleri Ajansı tarafından 2011 yılında yapılan bir araştırmaya göre, ülke, evlerinde gayri resmi toplantılar içermeyen sayıları 108.395 camiye ve 2.869 kiliseye ev sahipliği yapıyor.
