İnsanların yanı sıra, mavi balinanın düşmanları katil balinalar ve büyük köpekbalıklarıdır. Yetişkin mavi balinalar, herhangi bir katil balina veya köpekbalığından çok daha büyüktür, bu nedenle bu hayvanlar baldırlara saldırma eğilimindedir. Birkaç yaratık, dünyadaki en büyük yaratık olan sağlıklı bir yetişkin mavi balinayı bastırmaya muktedirdir. Mavi balinalar çoğunlukla krili besler.
Mavi balina buzağıları anneleri tarafından yakın durduğundan, katil balina kabuğunun stratejisi tükenene kadar anneyi ve baldırı rahatsız etmektir. Katil balinalar baldırı izole eder ve baldır kuruyana kadar nefes almasını engeller. Ancak, yetişkin mavi balinalarının katil balina saldırıları nedeniyle ağır şekilde yaralandığı durumlar olmuştur. Katil balinalar saatlerce mavi balina kovalayabilir, kuşatır ve hatta onu yenmek için sırtına fırlayabilir. Bu süre zarfında, kapsül ısırığının üyeleri, zayıflatmak için balinanın dışına fırladı.
Büyük beyaz köpekbalığı, algılamayı önlemek için arkadan veya alttan mavi balina baldırına yaklaşabilir. On iki ya da daha uzun olan çok büyük köpekbalıkları, balinalarından beslenen besinler nedeniyle mavi balinalar gibi deniz memelilerini hedef alma eğilimindedir.
