Kurbağalar, çoğu amfibi gibi, kloaca adı verilen bir delikten katı ve sıvı atıklar çıkarır. Sıvı atıklar kloaca idrar kesesi yoluyla atılması için girer. Katı atıklar kolondan girer.
Katı atıkların bir kurbağa tarafından salgılanması, sindirim sürecinin son ürünüdür. Çoğu kurbağa türü, etkili çiğnemeye izin vermeyen zayıf dişlere ve çene yapılarına sahiptir. Bir kurbağa tarafından yutulanın çoğu, önce midede kas kuvvetleri ve sindirim enzimlerinin ortaya çıkması ile parçalanır. Daha sonra, safra ve pankreas sularının yiyeceği daha da parçaladığı ve besinlerin kurbağanın içine emilmesine izin verdiği ince bağırsaklara hareket eder. Sonra fazla suyun giderilmesi için kalın bağırsaklara gider. Son olarak, tahliye için kolondan kloaca gider.
Bir kurbağanın attığı sıvı atık, amonyak, üre veya ürik asitle birleştirilmiş sudan oluşur. Azotlu maddeler kurbağanın kanından, iki böbrekten oluşan böbrek sistemi ile süzülür. Atık, üreter yoluyla toplandığı idrar kesesine kanalize edilir ve daha sonra kloaca havalandırılır. Sudaki kurbağalar ağırlıklı olarak bu azot atığını amonyak olarak salgılarken, çoğu kara kurbağaları bunu üre olarak salgılar.