Joe Scarborough, TMZ’ye göre Ocak 2013’te boşandı. Çift, ilk olarak 2012 Eylül’ünde boşanma işlemlerine başladı ve uzlaşma şartlarına göre, ikisinin ortak vesayeti küçük çocuklar, Ekim 2015 itibariyle.
Joe Scarborough, eşine Susan Waren'den boşanma şartlarını, beş yıl boyunca ayda 30.000 dolar Susan eşine destek ödemesini ve ardından iki yıl boyunca aylık 25.000 dolar ödemeyi kabul ederek anlaşmıştı. Çift, evlilik evini işgal etmeye devam ediyor.
Scarborough, MSNBC'nin "Morning Joe" adlı ortak ev sahibi Mika Brzezinski ile romantik bir ilişkinin söylentilerini yalanladı Scarborough eski karısı Susan daha önce eski Florida Valisi Jeb Bush için çalışıyordu. "Morning Joe" ya ev sahipliği yapmadan önce Scarborough, ABD Kongre üyesiydi.