Javan kaplanları esas olarak About.com’a göre hızla büyüyen bir insan nüfusunun yararına tahrip edilip ekildiği için soyları tükenmişti. Onlar avlandı ve zehirlendi ve 19. yüzyılın başlarında Java'da ne kadar yaygın oldukları için zararlı olun. Yaban köpekleri Java ile tanıştığı zaman av için rekabet de artmıştı.
II. Dünya Savaşı'ndan sonra, tik, kahve ve lastik için kullanılan tarlaları yapmak için birçok doğal orman tahrip edildi. Ormanların bu şekilde parçalanması, doğal yaşam alanlarının hayvan yaşamını desteklemek için uygun olmalarının sona ermesine neden olmuştur. Javan kaplanının en önemli av türü olan Rus geyiği, 1960'lı yıllarda birçok ormandaki ve rezervlerdeki hastalıklardan etkilendi ve kaplanın düşüşüne katkıda bulundu.
O zamandan beri teyit edilmemiş görmeler olmasına rağmen, son belgelenen Javan kaplanı görüşü 1972’de gerçekleşti ve IUCN, 2003’te Javan kaplanının resmen soyunun tükendiğini ilan etti. Java adası ve adanın en uzak ve en uzak bölgesi olan Betin Dağı.
Bali kaplanından daha büyük olmasına rağmen, Javan kaplanı Asya anakara kaplanlarının dışında nispeten küçük bir alt türdü.
