Dikdörtgen bayrağı olmayan ülkeler Nepal, İsviçre ve Vatikan'dır. Bu bayraklar kare şeklindedir, Nepal'i kurtarır. Çift pennon ya da iki üçgen şeklinde bir bayraktır.
Nepal bayrağı, orman gülünün rengini, ulusal çiçeği temsil eden parlak kırmızıdır. Renk aynı zamanda Nepal halkının da ilkesini temsil ediyor. Üst pennon, hilal ayını ve altta güneşi gösterir. Bayrak sınırı, barışı simgeleyen mavidir. Bazıları ayrıca iki pennenin, Hinduizm ve Budizm olan iki büyük dini dini sembolize ettiğini düşünüyor. Ayrıca Nepal'in bulunduğu Himalayaların zirvelerini de temsil edebilirler.
İsviçre bayrağı kare şeklindedir ve kırmızı bir arka plan üzerinde beyaz bir haç içerir. Onur, özgürlük ve sadakati sembolize ediyor. 1889'dan beri ulusal bayraktı ve ülkenin en eski kantonlarından biri olan Schwyz bayrağıyla modellenmişti.
Vatikan, dünyanın en küçük ülkelerinden biri ve Papa tarafından yönetiliyor. Kare bayrağı 1929'da kabul edildi ve parlak sarı yarıya ve beyaz yarıya sahip. Sarı yarı boştur, ancak beyaz yarı St Peter ve papal tacının altın ve gümüş anahtarlarını tutar.