Gılgamış Destanı birçok ahlaki temaya sahiptir, ancak ana tema aşkın motive edici bir güç olduğudur. Bu destandaki diğer ahlaki temalar ölümün kaçınılmazlığı ve tanrılarla başa çıkma tehlikesi .
Enkidu ve Gilgamesh'in arkadaşlığı içindeki aşk, her ikisine de farklı şekillerde daha iyi erkekler olma konusunda ilham verir. Gilgamesh, Enkidu'yu kendi merkezli biçimlerinden çıkarmayı başardı ve Enkidu'ya soylu olmaya ilham verdi. Buna karşılık Enkidu, Gilgamesh'in huzursuzluğunu kontrol eder ve Gilgamesh'i zorbalık ve zulmünü durdurması için motive eder ve daha iyi bir kahraman ve kral olmasına izin verir. Bağlantıları Gilgamesh'in halkının ihtiyaçları ile iletişim kurmasını sağlıyor.
Bu destanda romantik bir kadın ilgisinin olmaması, erotik aşkın hiçbir rolü olmadığı anlamına gelmez. Enkidu'nun eğitimi onun cinsel başlangıcıyla bir tapınak arpasıyla başlar. Bu, iki kahramanın sorununu başlatan şeydir, çünkü onların aşk tanrıçası İştar'ı onaylamamasına rastlar. Sadece Gilgamesh, dünyadaki yerinin İştar'ın şeref yerine geri döndüğünü anladığı zamandır.
Gilgamesh'in öğrendiği bir başka büyük ders, insan ölümünün kaçınılmaz gerçeğidir. Tanrıların ölümsüzlüğüne kızdı ve Enkidu acı bir ölümle öldüğünde, Gilgamesh kendi ölüm fikrinden daha çok korkuyor. Ölümden kaçma girişimi olan Utnapishtim'e yaptığı ikinci arayış, insanlara ölmesine rağmen insanlığın hala yaşadığını öğretiyor.
Hem Gilgamesh hem de Enkidu, duygusal ve mantıksız davranabilecekleri için tanrıların üstesinden gelmenin tehlikeli olduğunu öğrendi. Büyük sel yüzünden, tanrıların eylemlerinin insanlar tarafından anlaşılamayacağını öğrendiler. Mezopotamya’da, tanrılara karşı dindarlık ve saygı bir zorunluluk değil, doğanın gücünün pratik bir kabulü ve insanlığın şeylerin daha büyük düzenindeki rolünün hatırlatılmasıdır.