Domuzlar Körfezi'nin işgali Amerika Birleşik Devletleri'ni utandırdı, Başkan Kennedy ile istihbarat servislerinin arasına girdi ve Sovyetler Birliği ile Küba arasındaki ilişkiyi güçlendirdi. ”Sonrasında ABD’ye geçti. Sovyetler bir başka istilayı engellemek için Küba'ya malzeme ve silah göndermeye başlarken, Fidel Castro’yu empoze etmeye yönelik daha gizli yöntemler. Bu, 1962’de Küba Füze Krizi’ne yol açtı.
Kayıplar açısından, Domuzlar Körfezi'nin işgali, esasen bir çekilişti. Küba kuvvetleri 176 kişi öldü, en az 500 kişi yaralandı ve yaklaşık 4 bin kişi öldü. CIA ve gurbetçi güçleri 118 kişi öldü, 360 kişi yaralandı ve 1.202 kişi yakalandı. Küba'nın aldığı tutukluların bazıları daha sonra idam edildi. Sonunda, Küba 1.113 mahkumu yaklaşık 53 milyon dolarlık ekonomik yardım karşılığında takas etti. Castro ayrıca, yaklaşık 1000 gurbetçi akrabasının Küba'dan aile üyelerine Amerika Birleşik Devletleri'ne katılmak için ayrılmalarına izin verdi.
Domuzlar Körfezi'nden sonra Küba'da füze kuvvetlerinin kurulması, 1962 Ekim'inde ABD ile Sovyetler arasında bir soğukluğu tetikledi. Her iki taraftan da ateşli diplomatik söylem ve Küba’nın bir denizci ablukasından sonra Sovyetler, Amerikan füzelerinin Türkiye’de sökülmesi karşılığında füzelerin kaldırılmasını ve Küba’yı bir daha asla işgal etmeyeceklerine söz verdi.
