Birincil araştırmanın en büyük dezavantajı bilgi toplamadaki yüksek maliyettir. Benzer şekilde, bir araştırmacının çalışmaya hazırlanmak, ayrıntı toplamak ve bilgiyi tutarlı ve mantıklı sonuçlara dönüştürmek zorunda kalması çok zaman alır.
Birincil araştırma, toplumdaki belirli bir fenomen hakkında yeni bilgi toplama sürecidir. Birincil araştırmanın giderleri arasında kırtasiye, matbaa malzemeleri, ulaşım, konaklama ve telafi edici araştırma asistanları bulunur. Bir nüfus sayımı yapmak, büyük maliyetler içeren ve çok zaman alan birincil araştırmalara bir örnektir.
Bir kişinin önceden araştırılmış bilgileri elde ettiği ikincil araştırmalara kıyasla, birincil araştırma çok fazla zaman harcar. Birincil araştırmaya katılanlar çok ve çeşitli olduğu için, araştırmacı önyargılı veya yanlış bulgular elde etme riskini taşır. Ancak, bu dezavantajı, örneklenmiş bir kitleyi hedefleyerek ortadan kaldırılabilir.
Diğer bir dezavantaj, zamanlama faktörüdür. Birincil araştırmanın çok zaman alması nedeniyle, bulguları işlendikleri zaman ile ilgisiz olabilir. Birincil araştırma yöntemlerinden biri anketlerdir. Burada, katılımcılar soruları yanlış yorumlayabilir, yanlış veya istenmeyen geri bildirimlere neden olabilir. Bununla birlikte, birincil araştırmanın büyük bir avantajı, araştırmacının daha önce kullanılamayan, bilinmeyen veya tartışmalı olan bilgi toplama yeteneğine sahip olmasıdır.