Amazon Nehrinin Brezilya bölümünün ortalama derinliği yaklaşık 150 metredir ve maksimum derinlikler yaklaşık 300 metredir. Nehrin Manacapuru ve Óbidos arasındaki kesiminde, derinlik 66 ile 85 feet arasında değişmektedir.
Amazon Nehrinin boyutları mevsime göre değişmekte olup, Smithsonian Ulusal Hayvanat Bahçesi'ne göre, düşük nehir aşamasında 1 ila 6,2 mil genişliğinde ve yağışlı sezonda 35 mil kadar genişliktedir. Nehrin tamamı Andes Dağları'ndan başlayıp Atlantik Okyanusu'na boşalan yaklaşık 4.195 mil uzunluğundadır. Nehrin boşalması yıllık olarak saniyede yaklaşık 6.350 milyon fit küp ile ölçülür.