Uyku yardımının resmi web sitesinde listelenen Alteril'deki iki ana bileşen olan L-triptofan ve kediotunun bazı yan etkileri, WebMD'ye göre mide ekşimesi, mide ağrısı ve baş ağrısını içerebilir. Mayo Clinic, madde melatoninin yan etkileri baş dönmesi ve gündüz uykululuk içerebilir.
L-triptofan, mide ağrısı, mide ekşimesi, gaz, geğirme ve iştah kaybına, mide bulantısına, kusmaya ve ishale neden olabilir, WebMD'yi belirtir. Bu madde ayrıca cinsel problemlere, bulanık görmeye, baş dönmesine ve baş ağrısına neden olabilir. Uzun vadeli semptomlara ve hatta ölüme neden olabilen nörolojik bir durum olan 1.500'den fazla eozinofili-miyalji sendromu vakası, muhtemelen kontamine olmuş L-triptofan ürünlerinin kullanımı ile ilişkilendirilmiştir. Kediotu yan etkileri, heyecanlanma, sabah halsizliği, baş ağrısı, uykusuzluk ve huzursuzluk içerebilir. Tıbbi miktarlarda kısa süreli olarak büyük olasılıkla güvenli olsa da, valerian'ın uzun süreli kullanımda güvenliği 2015 itibariyle bilinmemektedir.
Mayo Clinic'e göre baş ağrısı, gündüz uykusu ve baş dönmesi melatoninin en sık görülen yan etkileridir, ancak madde aynı zamanda sinirlilik, konfüzyon, karın rahatsızlığı, hafif kaygı ve kısa süreli depresif duygulara neden olabilir. Melatonin, doğum kontrol hapları, diyabet ilaçları, immünosüpresanlar ve kan inceltici ilaçlar gibi bazı ilaçlar ile etkileşime girebilir. Üretici, Alteril'in çocuklar tarafından kullanılmasına karşı tavsiyede bulunur ve hamile kadınlar, Alteril.com'da belirtildiği gibi, ilk önce doktora danışmadan uyku yardımını kullanmamalıdır.