Yunanistan'da ana din Yunan Ortodoksudur. Yunan hükümeti resmi din istatistiklerini tutmasa da, Birleşik Devlette bu Hristiyanlık şubesinin Yunan sakinlerinin yaklaşık yüzde 98'ini oluşturduğu tahmin edilmektedir.
İslam, Yunanistan’daki en yaygın ikinci dindir. Bir grup Müslüman, Trakya'da yaşıyor. Nüfusun yaklaşık yüzde 1.3'ünü oluşturan bu 150.000 topluluk, 1923 tarihli Lozan Antlaşması kapsamında, I. Dünya Savaşı'ndan sonra Müttefik Güçler ile Türkiye arasındaki düşmanlığı sona erdiren resmi bir azınlık statüsüne sahip. Orta Doğu, Orta Asya ve Kuzey Afrika'dan 500.000 ila 700.000 Müslüman'ın Atina çevresindeki bölgede yaşadığı tahmin ediliyor. Scientology, Roma Katolikliği, Yehova’nın Şahitleri ve Musevilik gibi diğer dinlerin küçük toplulukları, Yunanistan’ın dini cemaatini kuşattı.
