USB 2.0 ve USB 3.0, aktarım hızı, güç yönetimi yeteneği ve yapı bakımından farklılık gösterir. USB 3.0 daha yüksek aktarım hızları, maksimum veri yolu gücü ve daha iyi güç yönetimi sunar.
USB 2.0 ve 3.0 arasındaki en büyük fark, her birinin bilgisayarın ana denetleyicisi ile iletişim kurma hızıdır. USB 2.0, 480 Mbps aktarma hızı sunar. USB 3.0, 2.0'dan 10 kat daha hızlı olan 4.8 Gbps'lik bir aktarım hızı sunar ve bu sayede cihazlar ile bilgisayar arasında veri aktarımında devrim yaratır. Bazı durumlarda, bu aktarım hızı kullanılan cihaza ve ayrıca veri yolu, bağlantı noktası ve kablo türüne göre değişir.
Yapı açısından USB 2.0 konektöründe dört tel bulunurken, USB 3.0'da telleri sekize ikiye katlayan ekstra bir fiziksel veri yolu vardır. USB 3.0 bağlacı USB 2.0 bağlantı noktasıyla geriye dönük uyumlu olsa da, bağlantı yalnızca 2,0 hızda çalışır.
Güç kullanımı ve gereksinimlerinde USB 2.0, 500mA'ya kadar sağlarken, USB 3.0 900mA'ya kadar güç sağlar ve güçle aç cihazların veri yolunu güçlendirmesini kolaylaştırır. 3.0 USB aygıtları, aygıt boştayken ve şarj sırasında güç kullanmak ve güç tasarrufu sağlamak için daha fazla güç sağlar. Kullanılmadığı zaman cihazların gücü tamamen kesiliyor.