Todar'ın Çevrimiçi Bakteriyoloji Ders Kitabı'na göre, seçici toksisite, antibiyotiklerin seçici olarak bakteri hücrelerini hedefleme yeteneğini, ancak insan hücrelerine karşı toksisitesinin olmadığı anlamına gelir. En seçici olarak toksik antibiyotikler bakteriyel hücre duvarı sentezini, bakteriyel nükleik asit sentezini veya bakteriyel protein sentezini hedefler.
Seçici toksisiteyi ölçen bir antibiyotik terapötik indeksi, Todar'ın Çevrimiçi Bakteriyoloji Ders Kitabı'na göre, bir insana ne kadar toksik olduğu ile bir enfeksiyonu yenmek için ne kadar gerekli olduğu oranıdır. Seçici toksisite ölçümleri sadece insan hücrelerini ifade eder; Bağırsaklardaki gibi normal olarak bulunan bakteriler üzerindeki etkiler ayrı ayrı ölçülür.