Pennsylvania’daki en büyük su kaynakları; Erie Gölü, Delaware Nehri, Conneaut Gölü, Wallenpaupack Gölü, Susquehanna Nehri, Allegheny Nehri, Monongahela Nehri ve Ohio Nehri'dir. Allegheny-Monongahela-Ohio nehir sisteminin önemli kollarıdır.
Pennsylvania eyaletinde 250 civarında doğal göl vardır. Bunların çoğu kuzeydoğu ve kuzeybatı bölgelerinde bulunur. Pennsylvania, Ohio eyaletinin sınırında bulunan Pymatuning Rezervuarının 21 mil kareden daha fazlasına sahip. Appalachian Dağları'ndan gelen suyun neredeyse yüzde 46'sı Susquehanna Nehri ve yan kolları tarafından boşaltılıyor. Pennsylvania'nın doğu sınırı, Delaware Nehri tarafından oluşturulmuş, batı kısmı ise Allegheny ve Monongahela nehirleri tarafından boşaltılmıştır.
