Pakistan'daki başlıca yeryüzü şekilleri arasında Khyber Geçidi, Bolan Geçidi, Balochistan Platosu, İndus Nehri ovası, Hindu Kush, Karakoram Range ve Himalaya Dağları bulunmaktadır. Pakistan'daki en yüksek kot, deniz seviyesinden 28.269 fit yükselen Himalaya Dağı zirvesi K2'de bulunur.
Pakistan'daki ek dağlık bölgeler, tümü kuzey dağlık olarak bilinen ülkenin bir bölümünde bulunan Safed Koh Range, Sulaiman Range ve Kirthar Range'dir. Pakistan ile komşu Afganistan arasındaki sınırı geçen bu dağlar arasındaki geçişler arasında Hocak Geçidi ve Broghol Geçidi daha kuzeyde yer alıyor. Indus Nehri'nden etkilenen bölge olarak nitelendirilen Indus ova alanı, hem üst hem de alt Indus Nehri havzalarını içerir. Potwar Platosu, İndus ovasındaki daha yüksek kotları içerir ve Himalaya Dağlarının eteklerinde bulunur. Indus Vadisi Çölü, Indus ovalarında da bulunur. Pencap Ovası, İndus Nehri ile Hindistan sınırı arasındaki alandır. Belucistan Platosu ülkenin güneybatısında ve İran sınırına açılıyor. Kharan Çölü, ülkenin güneybatısında yer almaktadır. Pakistan hem Avrasya hem de Hint tektonik plakalarını kapsıyor.
