Mojave Çölü, 34-38 derece Kuzey enlemleri arasında yer almaktadır. Amerika Birleşik Devletleri'nin güneybatı bölgesinde, Güneydoğu Kaliforniya'yı ve Arizona, Nevada ve Utah bölgelerini geçmektedir. Sonoran Çölü Mojave'nin güneyinde, Büyük Havza Çölü kuzeydedir.
Mojave Çölü, Pahrump Vadisi, Ölüm Vadisi, Amargosa Vadisi ve Las Vegas Vadisi'nden oluşur. Çölün Kaliforniya bölgesi, Batı Mojave, Orta Mojave ve Doğu Mojave'ye ayrılmıştır. Mojave Çölü, California’daki San Bernardino ve San Gabriel dağlarından doğuya doğru Arizona’nın kuzeybatı bölgesine ve Nevada’nın güney kısmına yayılıyor.