Orta Doğu'daki su kaynakları arasında Amu Darya Nehri, Fırat Nehri, İndus Nehri, Dicle Nehri, Basra Körfezi ve Nil Nehri bulunur. Orta Doğu'daki en büyük göl, 2.000 kilometrekare yüzölçümüne ve maksimum 52 fit derinliğe sahip olan İran'ın kuzeybatısındaki Urmiye Gölü'dür.
Orta Doğu’daki ülkeleri sınırlayan su kaynakları arasında Hint Okyanusu, Akdeniz, Kızıldeniz, Karadeniz, Aden Körfezi, Arap Denizi, Basra Körfezi ve Hazar Denizi bulunur.
Mısır ve Akdeniz ile Kızıldeniz'i birbirine bağlayan insan yapımı bir su kütlesi olan Süveyş Kanalı, 1869'da ticari gemilere geçit açmıştır. 100 mil uzunluğunda ve 14 mil ve 9 mil .
Mısır'dan geçen 4.258 mil Nil Nehri, dünyanın en uzun nehridir. Ağzı Mısır'ın Akdeniz kıyısındadır.
Fırat nehri, Basra Körfezi'ndeki yolunu sonlandırarak Türkiye, Suriye ve Irak üzerinden akar. Babil antik kenti nehrin kıyısında bulunur.
İndus ve Dicle nehirleri, Basra Körfezi'ne de akan Shatt al Arab Nehri olmak üzere birleşti. Dicle Nehrinin uzunluğu 1780 mildir.