Lemurlar, tropik ormandaki habitatlarının tahrip olması nedeniyle tehlike altındadır. Bir diğer neden de, lemurun yaşadığı bölgelerde siyasi kargaşanın bir sonucu olarak artan yoksulluk nedeniyle ortaya çıkan hızlı kütüklenmedir. Avlanma aynı zamanda lemur popülasyonu için de bir risk oluşturmaktadır.
Bilinen 103 lemur türünün yüzde 91'i tehdit altında. Bu, Madagaskar lemurunun, Uluslararası Doğa Türlerinin Korunması Birliği Birliği tarafından neslinin tükenmesinin eşiğine yakın olarak adlandırılmasına neden oldu. 2015 itibariyle kritik olarak tehlike altında bulunan toplam 23 tür, Elli iki tehlike altında bırakılmış ve 19 tanesi savunmasız olarak listelenmiştir. Lemurlar, herhangi bir omurgalı grubundan en çok nesli tükenmekte olanlardır.
