2015 itibariyle, Kaliforniya Los Angeles Ürolojisi'ne göre doktorların iltihaplı mesaneyi tedavi etmek için kullandıkları ilaçlar pentosan polisülfat ve dimetil sülfoksittir. ABD Gıda ve İlaç İdaresi her iki ilacı da onaylamıştır. İnterstisyel sistitin tedavisi yoktur ve antibiyotik tedavisine cevap vermez.
Doktorlar pentozan polisülfat veya Elmiron'u hastalara ağızdan iltihaplanmayı azaltmak ve mesanenin dış yüzeyini kaplamak için ağız yoluyla verir, UCLA Ürolojisi'ni açıklar. Hastalar, doktorların doğrudan mesaneye yerleştirdikleri kateterlerden dimetil sülfoksit dozlarını alır. Doktorlar, ağrıyı ve enflamasyonu en aza indirmek ve dokuya zarar veren serbest radikalleri yok etmek için ilacı birkaç hafta arayla uygularlar. İnterstisyel sistit, hastalığın birden fazla nedeni olduğu için bireyselleştirilmiş hasta tedavi planları gerektirir.