Filipinler’de çeşitli su kütleleri bulunur. Bunlar nehirleri, koyları, körfezleri, şelaleleri, gölleri ve bataklıkları içerir. Filipinler adalardan oluşur; Sonuç olarak, eğer bütün su kütleleri baştan sona dizilmiş olsaydı, uzunluğu 17.500 kilometredir.
Manila Körfezi, Filipinler'de, başkent Manila'nın yakınında bulunan doğal bir limandır. Liman, Filipinler ile dünyanın geri kalanı arasındaki ticaret için önemli bir liman.
Ülkedeki en büyük üç nehir, Cagayan Nehri, Rio Grande de Mindanao ve Agusan Nehri'dir. Çağayan Nehri, Luzon adasının kuzey kesiminde yer almaktadır. Rio Grande de Mindanao ve Agusan Nehri, Mindanao adasında yer almaktadır. Palawan adasındaki yeraltı nehri turistler arasında popülerdir.
Maria Cristina Şelalesi, Filipinler'deki en büyük şelalelerdir. Agus Nehri üzerinde yer alan Maria Cristina Şelaleleri, bir başka popüler turistik yer. Düşmeler "ikiz düşmeler" olarak adlandırılır, çünkü nehir akışı düşmeden kısa bir süre önce bulunan bir kaya ile ayrılmıştır. 320 metrelik yüksek şelale, Iligan şehrinde bulunan endüstriler için ana hidroelektrik enerji kaynağıdır.
