Entegre paketlerin en büyük dezavantajı, tek başına uygulamalara kıyasla daha az güçlü olmalarıdır. Genel amaçlı paketlere göre daha az özelliğe sahiptir.
Paket içindeki tüm uygulamalar tek bir lansmandan yüklendiğinden, gerçekleştirilen görev basit olsa ve çok fazla bilgi işlem gücü gerektirmiyorsa bile hepsi aynı anda belleğe yüklenir.
Eksikliklerine rağmen, entegre paketler genellikle ayrı programlardan daha ucuzdur. Entegre bir yazılım paketindeki tüm uygulamalar genellikle benzer bir grafik kullanıcı arayüzüne sahiptir, bu da uygulamanın sorunsuz ve basit bir şekilde değiştirilmesini sağlar.
