Annette Funicello'nun cenazesi Kaliforniya, Bakersfield'deki Cherished Memories Memorial Şapeli'nde yapıldı. Özel bir törendi. Bazı hesaplar, Funicello’nun Kaliforniya’daki Hollywood Hills’deki Forest Lawn Memorial Park’a gömüldüğünü iddia ediyor, ancak bu raporlara itiraz edildi.
Ms. Funicello, immün sistemin sinirlerin koruyucu örtüsünde yediği bir hastalık olan multipl sklerozla ilgili komplikasyonlardan uzaklaştığında 70 yaşındaydı. Funicello 1992 yılında sağlığını kaybettiğini açıkladı. Funicello'nun MS'ten muzdarip olmaya başladığını belirten işaretler, Funicello'nun aktör Frankie Avalon'la çalışırken başını döndüren büyüler yaşadığı 1987 yılına kadar farkediyordu. O sırada konuyu ele almadı.