Bir yer üstü havuzunu temizlerken ilk adım, filtreyi çıkarmak ve bir bahçe hortumu ile yıkamak, ardından havuzun iç duvarlarını iyice fırçalamak ve vakumlamaktır. Konsantre klor ile yapılan haftalık işlemler, biriken artıkları giderir ve suyu temiz tutar. Tutarlı klor tabletleri, tutarlı bir temizlik sağlamak için havuzun otomatik besleyicisinde veya skimmerinde tutulmalıdır.
Yer üstü havuzları yosun kolonizasyonuna eğilimlidir. Algleri gidermek için ilk adımlar havuza konsantre klorinle muamele etmek ve pompayı günde 24 saat su sirküle etmek üzere ayarlamaktır. Klor işlemi başladıktan sonra, bir sonraki adım havuzun iyice fırçalanması ve vakumlanmasıdır. Yosun dağılıncaya kadar işlemin günlük olarak tekrarlanması yinelemenin önlenmesine yardımcı olur. Ayrıca haftalık algaecide tedavileriyle yosun önlenebilir.
Pompa, bakterileri filtrelediği ve yosun oluşumunu en aza indirdiği için herhangi bir yer üstü havuzunda en önemli unsurdur. Uygun su sirkülasyonunu sağlamak için havuz sahiplerinin havuz filtresini her gün 8 ila 12 saat arasında çalıştırması önemlidir. Aşırı asitli veya aşırı alkali su, ekipman korozyonunun yanı sıra cilt ve göz tahrişine neden olabilir. Suyun haftada iki kez test şeritleri ile test edilmesi, havuz suyunun dengeli ve güvenli kalmasına yardımcı olur.