Bir septik tankla ilgili genel sorunlar, drenaj alanındaki çamur ve delikler, drenaj alanındaki fazla su, tankın katı madde işlememesi, septik tank üzerindeki toprağın sıkışması ve septik tankın yakınında büyüyen bitkilerdir. . Septik tank içerisinde biyolojik olarak parçalanamayan ürünlerin birikimi ve içindeki alglerin büyümesi diğer problemlerdir.
Drenaj alanına giren çamur, septik tank içeriğinin evde yedeklenmesine neden olabilecek drenaj deliklerini tıkar. Bu sorun, depoyu düzenli olarak dışarı pompalayarak çözülür.
Kısa bir süre içerisinde drenaj alanına büyük miktarlarda giren su, alanın atık su ile doyurulmasına yol açar. Bu suyun birikmesine izin verilirse, boru armatürlerinde yedeklenmeye neden olabilir. Ayrıca, fazladan su, katı maddenin işlenmesini önler ve katı madde daha sonra dağıtım borularını tıkayabilir.
Septik tankın katı atık işlememesinin bir başka nedeni de tanka vinil, kağıt ve biyolojik olarak çözünmeyen ürünlerin eklenmesidir. Bu malzemeler tank alanını doldurur, suyun hızla dolmasına neden olur ve yüzen katı maddeyi dağıtım borularına iter.
Toprağın tank üzerinde sıkışması, üzerine ağır araçlar ve ekipmanlar yerleştirildiğinde meydana gelir. Sıkıştırılmış toprak septik sistemin bileşenlerine zarar verir ve drenaj alanının atık suları kolayca dağıtmasına izin vermez.
Fosseptikte kullanılan deterjanlarda bulunan fosfatlar, dağıtım sistemini tıkayan alglerin büyümesini destekler. Tankın yakınında büyüyen bitki kökleri tanka, borularına ve drenaj alanına zarar verebilir.