1510 ve 1511'de Rafael, felsefe bilgisini Vatikan'daki Apostol Sarayı'nın duvarlarındaki bir dizi freskte dört bilgi dalından biri olarak göstermek için Atina Okulu'nu boyadı. Papa Julius II, tabloyu devreye soktu, ancak Rafael'e fresk temalarıyla ilgili özel talimatlar verip vermediği bilinmiyor.
Resimleri tutan odalar Stanze di Rafaello olarak bilinir. Fresklerde temsil edilen dört bilgi dalı şiir, hukuk, felsefe ve teolojidir. Birçok sanat tarihçisi tarafından Rafael'in şaheseri olarak kabul edilen Atina Okulu, geniş bir mahkemede eskiden tonozlu 21 sanatçı ve filozofa sahip. Bunların üstünde mitolojik Yunan tanrılarının Apollo, ışık ve müzik tanrısı Apollo ve bilgelik tanrıçası Athena vardır.
Resimdeki merkez, gri saçlı yaşlı bir adam olarak Plato ve açıkça Plato'nun öğrencisi olan genç bir adam olan Aristo'dur. Diğer filozoflar daha az özdeşleşir, çünkü hiçbir tarihsel imgesi yoktur. Kimlikleri tarihçileri oldukça kesin olan rakamlar arasında Sokrates, Euclid, Ptolemy, Pisagor ve Zoroaster sayılabilir. Bu filozoflar farklı zamanlarda yaşadılar, Rafael onları genel felsefi bilgi temasını kapsayacak şekilde bir araya getirdi. Rafael ayrıca kendisini filozofların 21 filosundan biri olarak resmetti.